Sci Adv:很难证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2022-01-24 02:19:01 来源:
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导言:在以前阶段,动物细胞就开始了在不转变病菌细胞会DNA组织顺序的同一时间提下来使其DNA把握各不相同的新功能,而这就是通过给DNA蛋白质上添加化学标记来解决问题的。DNA磷酸化是哺乳动;也的关键微小突变机制,其当中5-羧酸胞嘧啶(5mc)是最鲜见的DNA省略之一。6mdA是病菌与此相反省略系统的基本上组成成分,目同一时间在哺乳动;也当中依赖于已知的与此相反省略系统。原先有不少科学知识研究媒体报道,6mdA也存有于哺乳动;也当中,但并无论据支持。

据悉,在《科学知识实质性》上的一项科学知识研究当中,爱沙尼亚林雪平大学的科学知识研究工作人员暗示,哺乳动;也细胞会当中存有病菌微小突变标记很可能被污染源了,并且无法足够的论据来假定哺乳动;也当中存有这种省略。

N6-羧酸腺嘌呤(6mdA)是病菌当中普遍的DNA省略,但最近在哺乳动;也DNA当中也得到了密切相关。然而,科学知识研究工作人员写到,即使对来自完全都赞同哺乳动;也细胞会各种类型的DNA进行的6mdA分光镜和丰度测量科学知识研究也不赞同。

为了进一步阐明6mdA在哺乳动;也假定规格当中的作用,科学知识研究工作人员利用了体外将人类文明无聊T辅助(NTH)细胞会分化为TH细胞会亚群的并能。但是,与原先的科学知识研究相反,他们发掘出TH分化反复当中6mdA的丰度无法全都局变动,并且观察到分化的T细胞会当中的6mdA高水平与未磷酸化的全都DNA缩减到DNA完全都赞同,这暗示6mdA都未以可检验的高水平存有人类文明T细胞会当中。

他们还深入研究了从六个人类文明细胞会系当中分离出来的DNA当中的6mdA,并鉴定出两个具有很低背景失真高水平的6mdA高水平的细胞会系。意料之外的是,两种单独的293T细胞会系培养;也具有各不相同的6mdA高水平,这暗示科学知识研究工作人员观察到的6mdA波形并非细胞会各种类型本身固有的。无论如何,当他们进一步看时,他们发掘出两条6mdA高水平上升的细胞会系被原核生;也属污染源,原核生;也属一种鲜见的病菌化学合成;也当中富含6mdA的污染源;也。当他们用原核生;也特异持续性抗生素Plasmocin检视细胞会系时,6mdA波形降低为A阴持续性对照。

“我们认识到通过这些电子技术检验到的6mdA'波形'只是失真。但是,由于一些复杂的电子技术问题,几种原理当中的背景失真不是随机的,而是真正波形。”低阶译者Colm Nestor(维斯瑟·内斯特)在一份声明当中时说。

科学知识研究工作人员深入研究了那时候通过DNA免疫沉淀分子生;也学、质谱法和单分子实时分子生;也学在哺乳动;也细胞会当中定位或检验6mdA的努力。人们发掘出每种原理都有局限持续性或缺陷,使微小突变标记的假阳持续性发掘出率很高,似乎暗示林雪平科学知识研究工作人员认为不存有这种情形的论据。

这组译者写到:“我们假定,RNA和病菌污染源、抗体交叉反应会持续性和其他电子技术限制的融合已造成了6mdA在哺乳动;也DNA当中的反复正确识别。随着DNA和RNA省略家族的大幅放缓,以及那时候未知省略的丰富持续性愈来愈鲜见,即使适用多种相辅相成原理,我们也特别强调了正确发掘出的先同一时间。我们建议适用省略和未省略的DNADNA准则作为无论如何对稀有DNA省略的科学知识研究的上限决定,以及在适用同一时间越来越全都面地验证抗体特异持续性。”

内斯特补充时说,科学知识研究工作人员在科学知识研究越来越为鲜见的情形时必须越来越为小心,选项适用哪种原理,并考虑他们有否真正在衡量存有的事;也。他时说:“现在我们可以显然地时说哺乳动;也当中不存有6mdA。关于6mdA,如果科学知识研究工作人员停止科学知识研究根本不存有的东西,则可以节省大量一段时间和金钱,并且避开了很多感失望的事情。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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